关于入职协议中违约金设定的合理性问题，须针对实际情形予以细致分析。
一般来说，当约定的违约金是由于用人单位向劳动者提供了特定金额的特殊培训经费，进行了正规的职业技能培训，并设定了相应的服务期限时，假如劳动者在合同期限内违反应尽义务，此时的违约金设定则被广泛认为是合理可行的。
然而，若违约金的设定仅仅是对劳动者的自主离职权构成限制，例如简单地约定合同期满前离职即需要承担违约金，这样的条款往往被视为不合理乃至违法。
除此之外，我们还应审慎评估违约金的具体数额是否明显超出合理范围，因为过高的违约金很可能无法获得法律的认可与保护。
总的来说，对于入职协议中违约金设定的合理性判断，必须结合用人单位是否具备合法的约定依据、约定的形式及实质内容是否遵循相关法律法规等多方面要素加以全面考虑。