尚未进行备案的合同印章并不一定意味着其行为效力将被判定为无效。
在一般情况下，只要在签订合同时，缔约双方均出于自愿并表达了真实意愿，并且所签署的内容与法律法规的强制性规定无冲突，那么该份合同便具备合法有效的法律效力。
然而，在某些特殊的行业或者特殊场景中，法律法规明确规定只有经过相关部门进行合规备案的合同印章方能具有真正的法律约束力，此时未进行备案的合同印章便有可能导致合同的法律效力受到质疑。
例如，在金融业、建筑业等受严格监管的领域内，这种情况尤为明显。

《中华人民共和国民法典》第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。