在特定的条件下，由书面手写签署的合同中所包含的违约金条款具有其合法效力。
首先，作为组建有效合同的基本要求，该合同必须真实反映了签订双方对于合同内容的真实意愿，并且在签署过程中没有任何形式的欺诈行为或者对一方进行胁迫等违法行为发生。
其次，该份合同的内容不得违反国家颁布实施的有关法律法规的强制性规定，同时也不能有悖于社会道德规范，即公序良俗。
对于合同中的违约金设定，则应当清晰明了且具备合理性。
倘若原定违约金与实际所导致损失间的比例超出合理范围，即所谓过高，签约双方均有权通过向法院或仲裁机关申诉的方式，寻求对此进行适当调整。
在此需指出的是，过高通常专指违约金超过实际损失额的30%。
总言之，只要遵循上述法律框架，手写合同中关于违约金的约定便有可能被认定为有效，然而，其有效性以及具体适用方式还需根据具体情况以及相关证据材料进行综合评估和判定。