对于协议备注的法律效应能否认可，这需要根据具体情况进行评估和分析，无法给出明确统一的答案。
一般来说，倘若协议的备注是由协议双方在平等、自由以及公正的原则下达成的共识，并且其内容没有触犯任何法律法规的强制性规范，也不会对公共秩序和善良风俗造成不良影响，同时，该备注还能有效地补充和连接到协议的主要条款之上，那么这样的备注通常都会被视为具有法律效应。
然而，若协议备注存在下列几种情况，就可能会被认定为无效：
首先，这种备注的内容显著地违反了公平原则，并严重侵害到了某一方的合法利益；
其次，它与法律、行政法规的强制性规定相抵触；
最后，如果备注并非双方真实意愿的体现，而是存在着欺诈、威胁等不当行为。
总的来说，要准确地判断协议备注的法律效应，必须综合考虑各种复杂的因素。