法院认定变更合同关系如下：
(一)合同变更的条件：
1、原合同关系有效成立。
2、合同要素发生变化。
3、合同的变更必须有合法依据。
4、符合法律要求的方式。
(二)合同变更的效力：
1、合同变更部分取代被变更部分，原合同未变更部分仍然继续有效。
2、合同变更原则上仅向将来发生效力，对已经履行的部分没有溯及力，已经履行的债务不因合同的变更失去其法律依据。
3、合同的变更并不影响当事人要求赔偿的权利。

《民法典》第五百四十三条
当事人协商一致，可以变更合同。