在签订合同后，发现有些事项未约定完善，往往会再签订一份补充合同。补充协议是否有效，不能一概而论，分具体情况看：
1、如果从补充协议的内容能确定合同主体及相关的权利义务关系，该补充合同就是独立的有效合同，而不是属于原合同的从合同。那么，即使主合同无效或被撤销，也不影响补充协议的效力。
2、如果从补充协议内容不具有独立性，必须结合原合同的内容才能确定合同主体以及双方的权利义务，那么该补充合同实际上是原合同的从合同，原合同有效，则补充协议有效;原合同无效，则补充协议也无效。
3、也有可能存在补充协议与原合同的内容相互矛盾或不一致的的情况，如原合同和补充合同都没有特别约定两份合同出现矛盾或不一致的情况，必须以哪份合同的内容为准，那么补充协议时间一般在后，应以补充协议为准。

《民法典》第五百一十条
合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充;不能达成补充协议的，按照合同相关条
款或者交易习惯确定。