仅凭借款凭证能否被法院判定为无效，需结合多项因素进行全面分析。
通常情况下，倘若借款凭证自身存在显著缺陷，如形式不够严谨、欠缺重要信息要素、其真实性受到严重质疑，甚至当事人能够出具具有说服力的反向证据来证明双方之间的借贷关系并不存在，基于此种情况，仅凭借款凭证所做出的驳回判决便可能存在争议。
然而，若借款凭证形式完整无缺、内容明确易懂，并且并未出现任何足以推翻其效力的反面证据，那么依据相关法律法规以及审判实践经验来看，基于该借款凭证所做出的判决结果有可能被认定为有效。

《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》第二条
出借人向人民法院提起民间借贷诉讼时，应当提供借据、收据、欠条等债权凭证以及其他能够证明借贷法律关系存在的证据。
当事人持有的借据、收据、欠条等债权凭证没有载明债权人，持有债权凭证的当事人提起民间借贷诉讼的，人民法院应予受理。被告对原告的债权人资格提出有事实依据的抗辩，人民法院经审查认为原告不具有债权人资格的，裁定驳回起诉。