在向法院提起诉讼时，务必确保各项条件均已具备，其中包括了明确的诉讼请求以及详细的事实依据与理由阐述。
倘若原定的借款协议被确认为不生效力，那么这个因素很可能成为我们提起诉讼时所需陈述的事实及理由的一个重要组成部分。
因此，即便借款协议存在效力问题，只要能够满足诸如原告与案件之间具有直接的利益冲突、明确的被告身份、以及该案属于人民法院所能受理并拥有管辖权等其他必要条件，那么法院就应依照法律规定予以立案处理。
换言之，借款协议本身的无效性并不能直接影响到法院是否会对相关案件进行立案审理，关键之处在于我们是否已经充分满足了《中华人民共和国民事诉讼法》中所规定的起诉条件。

《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十二条
起诉必须符合下列条件：
（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；
（二）有明确的被告；
（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；
（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。