依据我国法律规定，缔结的合同自签订之日即刻生效，除非存在特殊情况，法律另做规定或者双方当事人共同作出决定。
若合同签署后需要办理审批等其他必要手续，则须按照国家法律、行政法规的相关规定进行处理。
未及时完成此类手续或许会对合同的生效产生一定程度的影响，但这并不会改变合同中涉及到的报批等义务条款以及相关条款的法律效力。
若当事人未能履行申请审批等手续的职责，对方有权请求其承担相应的违约责任。
对于借款补充协议的法律效力问题，补充协议只要是依法产生且没有触犯法律、行政法规所规定的必须办理审批等手续的要求，便可在双方当事人之间产生法律约束力。
若补充协议需要办理审批等手续却未按规定执行，那么这可能会对补充协议的法律效力产生影响，但同样不会改变补充协议中涉及到的报批等义务条款以及相关条款的法律效力。
因此，判断借款补充协议的法律效力是否有效，需要结合具体情况，深入分析补充协议的内容、形成过程以及是否需要办理审批等手续。
若补充协议符合法律规定，且已依法成立，那么它便是具有法律效力的。
反之，若补充协议未依法成立或需要办理审批等手续却未按规定执行，那么它就可能被判定为无效或法律效力受到限制。

《中华人民共和国民法典》第五百零二条
依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。
依照法律、行政法规的规定，合同应当办理批准等手续的，依照其规定。未办理批准等手续影响合同生效的，不影响合同中履行报批等义务条款以及相关条款的效力。应当办理申请批准等手续的当事人未履行义务的，对方可以请求其承担违反该义务的责任。
依照法律、行政法规的规定，合同的变更、转让、解除等情形应当办理批准等手续的，适用前款规定。