通常来讲，那民事调解书里的抚养权，就算过了两年，还是可以去执行的。
要是对方没有按照调解书里规定的抚养权相关义务去做，那另一方就能够在两年的申请执行时效这段时间里，把案子交到法院去申请强制执行。
不过，如果出现了时效中断或者中止之类的情况，那申请执行的期限就有可能变长。
就像在时效期间内，权利人跑去跟对方主张自己的权利，或者对方同意要去履行义务，这些情况都有可能让时效中断，然后又得重新开始计算两年的申请执行期间。
所以，就算已经超过了两年，也得具体问题具体去分析，得看看到底存不存在能让时效中断或者中止的情形，这样才能确定到底还能不能去申请执行。
要是自己不太确定的话，最好还是去咨询一下专业的律师，让他们给咱好好说说这事儿。