在处理子女抚养权问题时，男方是否发生婚外情并非决定子女抚养权归属的唯一要素。
在司法实践中，法院往往需要全面审视诸多相关因素，例如子女的年龄、个人意愿，双方法定或客观经济实力、实际抚养能力以及抚养条件等多种因素。
若子女尚处于年幼阶段，从保护其利益及给予恰当呵护的角度出发，往往会倾向于将子女判由母亲进行监护；
然而，若母亲因身体原因，如感染严重疾病或形成了某些不良行为习惯等而无法适当履行监护职责，那么法院亦有可能将子女的抚养权交由父亲。
总体而言，法官在进行裁决过程中会始终坚持以尽可能保证子女健康快乐地成长为首要原则。

《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条
父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。