在婚姻关系中，若有一方存在不道德的外遇行为时，关于两个孩子监护权判决的问题便显得尤为复杂。
在这时，法院必将以公正公平之心，依据多种因素进行全面衡量，例如孩子的年龄、个人意愿、父母双方的抚养能力以及家庭环境等等。
倘若出轨方的不当行为对孩子的身心发展造成了负面影响，那么未出轨的一方在争夺孩子监护权的过程中，无疑将占据更大的优势地位。
然而，这并不意味着结果必然如此，最终的决定权仍取决于哪一方能够为孩子创造更为稳定、健康且有利于其成长的生活环境。

《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条
父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。