在分居期间处理子女抚养权问题时，需要全面考量诸多复杂因素以作出恰当判断。
一般情况下，司法机关会将子女的年纪、生活环境以及双方的抚养能力与条件等因素列入重要评估范畴之内。
当子女仍处于哺乳阶段时，法院往往倾向于将抚养权判归母亲所有；
而当子女已经具备明确表达个人意愿的能力时，他们的意愿亦将成为决定抚养权归属的关键性参考依据之一。
倘若有任何一方所提供的抚养条件明显优于另一方，则该方获得抚养权的可能性将会相应提高。

《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条
父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。