在办理子女抚养权公证书时，通常需要提交如下资料：
父母双方的有效身份证明文件以及户籍登记册；
孩子的出生医学证明；
能够明确抚养权归属的相关协议或者由法院所作出的具有法律效力的判决书；
以及公证申请书等相关文书。
值得注意的是，由于各地域及各公证机构的规定可能存在差异，因此具体所需提交的资料也会有所不同。

《公证程序规则》第十八条
自然人、法人或者其他组织申请办理公证，应当提交下列材料：（一）自然人的身份证明，法人的资格证明及其法定代表人的身份证明，其他组织的资格证明及其负责人的身份证明；（二）委托他人代为申请的，代理人须提交当事人的授权委托书，法定代理人或者其他代理人须提交有代理权的证明；（三）申请公证的文书；（四）申请公证的事项的证明材料，涉及财产关系的须提交有关财产权利证明；（五）与申请公证的事项有关的其他材料。