起诉离婚想要得到两个孩子抚养权，与对方协议不成的，由法院判决，法院按照有利于子女的原则判决，具体如下：
1、不满两周岁的子女，一般归女方抚养，除非女方有不适合抚养的法定情形；
2、已满两周岁不满八周岁的子女，由法院根据具体情况判决，两个孩子的情况下，一般是一人一个；
3、已满八周岁的子女，要尊重子女的意愿。

《民法典》第一千零八十四条
父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。