分居后一方有外遇，进行离婚财产分割原则上是均等分割，但应当照顾无过错一方，对无过错方可以多分财产。
双方当事人可通过自愿协商或法庭判决的方式对财产分割、配偶赡养费、子女抚养费等问题作出安排。
分居后有外遇的情况属于导致婚姻关系破裂的情形，那么有外遇的一方就是导致婚姻关系无法存续的过错方，分割财产要考虑夫妻双方的过错，因此，分居后有外遇的一方，在财产分割中出于劣势。

《民法典》第一千零八十七条
离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。
对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。