在夫妻双方处于分居状态且其中一方不幸患上严重疾病的特殊情境下，仍然可以根据相关法律规定选择通过协议离婚或者提起诉讼离婚的途径来结束婚姻关系。
然而，必须充分考虑患病一方所面临的现实困境与合法权益，确保其得到妥善处理。
如若双方能够就财产分割、子女养育等关键议题达成共识并签署协议书，便可遵循协议离婚程序；
倘若无法在此问题上取得一致，则应选择向管辖法院提起诉讼离婚。
在此类情形中，法院将根据双方之间的感情深厚程度、患病一方向另一方所提出的医疗救助与日常生活需求等多个方面进行全面评估，以作出公正合理的裁决。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。