可以。

结婚证被对方扣了能起诉离婚。无法出具结婚证的，可到婚姻登记机关开具证明材料起诉离婚。
起诉离婚需要提交起诉状一式两份、原告本人身份证、结婚证等证件材料，到被告住所地起诉立案，如果被告住所地与经常居住地不一致的，到被告经常居住地人民法院起诉立案。
符合起诉条件的，应当在七日内立案，并通知当事人；不符合起诉条件的，应当在七日内作出裁定书，不予受理；原告对裁定不服的，可以提起上诉。

《民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。