民事起诉被告不出庭的，司法机关可以根据不同的情况会作不同的处理：
1.如果被告是必须到庭的，例如离婚案件的被告，其不出庭，可以拘传到庭。
2.如果并非必须到庭的被告，可以作缺席判决处理，不影响案件的正常审理。

《民事诉讼法》第一百一十二条
人民法院对必须到庭的被告，经两次传票传唤，无正当理由拒不到庭的，可以拘传。
第一百四十七条
被告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以缺席判决。