离婚时宅基地上的房屋首先，按规定，农村宅基地房不能进行拍卖。
其次，双方可以协商确定谁占有房屋。
最后，按照地方习惯，农村男女离婚时，女方不大可能继续生活在该地方，所以实践中的做法是，将房屋判归男方所有，再由男方按房屋价值的一半补偿女方。

《民法典》第一千零八十七条
离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；
协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。
对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。