中介机构代理存储订金具有合法效力。订金原本应当由出售方直接收取，然而在现如今的市场交易环境中，买卖双方与中介达成协议，将订金交由第三方即中介机构代为监管并无任何违法违规之嫌。因此，这类协议仍然具备足够的法律效力。若当事人之间有约定，须要支付订金才能致使主合同正式成立或者生效者，那么虽然实际支付定金方并未履行支付义务，但是主合同已经得到全面执行或者执行了主要内容，这并不妨碍主合同的成立或者生效。

《中华人民共和国民法典》第五百八十六条当事人可以约定一方向对方给付定金作为债权的担保。定金合同自实际交付定金时成立。定金的数额由当事人约定；但是，不得超过主合同标的额的百分之二十，超过部分不产生定金的效力。实际交付的定金数额多于或者少于约定数额的，视为变更约定的定金数额。