对于商铺租赁协议产生的矛盾纠纷，可以选用以下四种途径进行妥善解决：
首先是协商谈判，各方应尽可能通过友好协商的方式寻求共识；
其次是调解机制，当双方在协商过程中遇到障碍时，可向相关部门提出申请，请求其从中协调并化解矛盾；
再次是仲裁程序，若经调解无果或双方不愿接受调解结果，则可选择进入仲裁程序，由公正权威的第三方机构对争议事项作出裁决；
最后是司法诉讼，若以上途径均无法解决问题，则可诉诸法律，通过法院审理判决来维护自身合法权益。
值得注意的是，关于因合同纠纷引发的诉讼案件，其管辖权通常归属于被告所在地或合同履行地的人民法院。

《民事诉讼法》第一百一十九条起诉必须符合下列条件：（一）原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；（二）有明确的被告；（三）有具体的诉讼请求和事实、理由；（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。《中华人民共和国民法典》第十条处理民事纠纷，应当依照法律；法律没有规定的，可以适用习惯，但是不得违背公序良俗。