在通过房地产经纪机构办理房屋交易过程中，如若该经纪公司强行扣押卖房者所持有的房产证并拒绝归还的话，当事人有权前往工商行政管理局进行投诉，或选择向法院提出诉讼申请以解决此问题。
根据我国相关法律法规的明确规定，人民法院对涉及其财产权属及人身纠纷的民事案件具有专属管辖权，此类案件均适用于本部法律。

《中华人民共和国民事诉讼法》第三条人民法院受理公民之间、法人之间、其他组织之间以及他们相互之间因财产关系和人身关系提起的民事诉讼，适用本法。第一百一十九条起诉必须符合下列条件：(一)原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织；(二)有明确的被告；(三)有具体的诉讼请求和事实、理由；(四)属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。