根据我国《中华人民共和国民法典》之规定，对于那些尚未取得所有权证明文件的房屋，利益相关者有权提出物权保护的申请，以通过合法确权的方式切实维护自身权益。具体而言，《民法典》第二百三十三条确立了物权纠纷的解决方式，即当物权遭受侵犯时，权利主体可选择和解、调解、仲裁或诉讼等多种途径进行维权。
同时，第二百三十四条明确指出，在物权的归属及内容存在争议的情况下，利益相关方均有权利提出确认权利的请求。

《中华人民共和国民法典》第二百三十三条【物权纠纷解决方式】物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。第二百三十四条【物权确认请求权】因物权的归属、内容发生争议的，利害关系人可以请求确认权利。