处理商铺买卖合同纠纷的方法主要包括：
首先，当事人可尝试经由自行协商达成共识，因为协商的结果往往是最为优先考虑的；若无法通过协商达成和解方案，则可以请求相关机构出面协助调解以寻找解决之道；而在调解失败或无法进行调解的情况下，如果合同中已经约定了仲裁条款，那么当事人便可以选择申请仲裁来解决争议；倘若合同中并未规定仲裁条款，当事人也可以选择向法院提起诉讼来维护自身权益。

《民法典》第四百七十条合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款：（一）当事人的姓名或者名称和住所；（二）标的；（三）数量；（四）质量；（五）价款或者报酬；（六）履行期限、地点和方式；（七）违约责任；（八）解决争议的方法。当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。《民事诉讼法》第一百二十二条当事人起诉到人民法院的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。《中华人民共和国仲裁法》第二条平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。