在处理购房者所引发的房产证纠纷时，我们应当采取以下措施：
首先，对于那些在提交办理房产证所需文件过程中出现不合格情况的，应立即予以纠正。
您可以寻求相关工作人员的指导与帮助，避免因疏忽而付出额外代价；
其次，对于个别购房者在入住后擅自搭建违章建筑，从而导致规划部门无法为其核发房屋竣工验收合格证的现象，应尽快对这些违法建筑进行拆除，以确保房产证的顺利办理。

《民法典》第二百一十六条不动产登记簿是物权归属和内容的根据。不动产登记簿由登记机构管理。第二百一十七条不动产权属证书是权利人享有该不动产物权的证明。不动产权属证书记载的事项，应当与不动产登记簿一致；记载不一致的，除有证据证明不动产登记簿确有错误外，以不动产登记簿为准。