1.这两类证件的内部构造有所差异。
2.它们所附带的权证编号亦各不相同。
3.在标注所有权信息方面，二者存在显著区别。
4.房产证必须加盖各地人民政府的公章才能取得法律效力，然而房屋产权登记证则需由监管机构进行确认并加盖公章方能生效。
5.房产证主要用于进行登记证明，而房屋产权登记证则侧重于代表所有权证明。

《城市房屋权属登记管理办法》规定:
国家实行房屋所有权登记发证制度，房屋权属证书是权利人依法拥有房屋所有权，并对房屋行使占有、使用、收益和处分权力的惟一合法凭证。
房产证，购房者通过交易，取得房屋的合法所有权，可依法对所购房屋行使占有、使用、收益和处分的权利的证件。