农村房屋权属争议一般由不动产所在地人民法院管辖，部分情况下可以由被告户籍地或居所地人民法院管辖。
在发生农村房屋权属争议时，双方可以通过协商处理，或者可以向人民法院起诉确权，以及可以向当地的人民政府申请确权。

《中华人民共和国土地管理法》第十四条
土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。