只丢失契证的，个人凭身份证、单位凭加盖公章的营业执照、机构代码证复印件（委托他人的还要有委托书，代理人身份证）到地税局档案科查档，然后凭档案科出具的《查档证明书》登报申明遗失作废，凭报纸公告与《房屋所有权证》到地税局办税大厅补办契证。
法律依据：
《中华人民共和国契税法》第四条
契税的计税依据：
（一）国有土地使用权出让、土地使用权出售、房屋买卖，为成交价格；
（二）土地使用权赠与、房屋赠与，由征收机关参照土地使用权出售、房屋买卖的市场价格核定；
（三）土地使用权交换、房屋交换，为所交换的土地使用权、房屋的价格的差额。前款成交价格明显低于市场价格并且无正当理由的，或者所交换土地使用权、房屋的价格的差额明显不合理并且无正当理由的，由征收机关参照市场价格核定。
纳税人申报的成交价格、互换价格差额明显偏低且无正当理由的，由税务机关依照《中华人民共和国税收征收管理法》的规定核定。