若商品房买卖合同中的违约责任条款设定标准在各自条款间有所出入，一般而言这并非必然导致该合同被判定为无效。
然而，若此类条款差异源于双发在公正、自愿及公平交易原则下达成共识，且没有触犯任何相关法律法规的禁止性规定，那么这些条款便相对具有法律约束力。
然而，倘若这类条款差异明显有违公平原则，或者存在欺诈、胁迫等不当行为，则可能对其法律效力产生不利影响。