商品房买卖合同办理备案手续的重要性在于，备案后的合同条款及其约定将获得法定效力，同时也受到主管行政部门的严密审察与有效监控，以期确保其合法性与公正性。
此外，该合同还将被纳入主管行政部门的公共档案体系之中，这对于强化房地产市场的监管力度以及信息管理工作都有着积极的推动作用。
更为重要的是，主管行政部门得以借助此项措施，对房地产市场实施更加严格的监管，从而规范开发商及购房者的行为准则。

《关于做好不动产统一登记与房屋交易管理衔接的指导意见》第二条加强房屋交易管理与不动产统一登记。加强房屋交易管理。房屋交易管理是房地产市场监管的基础和核心。各级房产管理部门要强化房屋转让、抵押、租赁、面积管理、房屋交易档案、房屋中介、个人住房信息系统建设等工作，特别是要做好商品房预售许可、房屋买卖合同网签备案、房屋交易资金监管、楼盘表的建立、购房资格审核、房源验核、存量房与政策性住房上市交易管理，以及房屋抵押政策制定及监督执行等交易监管具体工作，实现关联业务有序衔接。