在进行房地产买卖交易时，房产证的持有年限是五年内还是五年以上会产生如下差异：对于购买时间未满两年的房屋进行对外销售时，需要对其全部价值缴纳5.6％的增值税；而对于购买时间超过两年（包括两年在内）的非普通住宅进行对外销售时，则需按照差额来计算并缴纳增值税，而普通住宅则可以享受免税待遇；
此外，对于购买时间未满五年的房屋进行对外销售时，还需额外缴纳1％的个人所得税；
然而，当购买时间达到或超过五年后，该房屋对外销售时便可享有免缴个人所得税的优惠政策。

《关于个人住房转让所得征收个人所得税有关问题的通知》第五条
各级税务机关要认真落实有关住房转让个人所得税优惠政策口按照《财政部国家税务总局建设部关于个人出售住房所得征收个人所得税有关问题的通知》的规定，对出售自有住房并拟在现住房出售1年内按市场价重新购房的纳税人，其出售现住房所缴纳的个人所得税，先以纳税保证金形式缴纳，再视其重新购房的金额与原住房销售额的关系，全部或部分退还纳税保证金；对个人转让自用5年以上，并且是家庭唯一生活用房取得的所得，免征个人所得税，要不折不扣执行上述优惠政策，确保维护纳税人的合法权益。