1、概念不同：
股权质押又称股权质权，是指出质人以其所拥有的股权作为质押标的物而设立的质押。
存单质押是指借款人以贷款银行签发的未到期的个人本外币定期储蓄存单作为质押。
2、流程不同：
（一)、股权质押流程
1、可以申请股权出质的企业类型
（有限责任公司及未上市的股份有限公司)；
2、填写表格等材料；
3、现场材料提交；
4、领取股权出质通知书。
（二)、存单质押流程
1、具有完全民事行为能力的自然人；
2、持本人有效身份证件；
3、持有中国银行开具的未到期的个人定期本外币储蓄存单，定期一本通存折；
4、申请人持非本人名下存单，还应出示存单所有人有效身份证原件和存单所有人同意质押的书面文件；
5、持外币定期存单质押贷款的，借款人须持本人名下存单；
6、贷款人规定的其他条件。

《民法典》第四百四十一条
以汇票、本票、支票、债券、存款单、仓单、提单出质的，质权自权利凭证交付质权人时设立；
没有权利凭证的，质权自办理出质登记时设立。法律另有规定的，依照其规定。