关于减免的增值税应如何缴纳企业所得税的问题，根据相关法律法规，具体如下所述：
首先，出口退税以及属于国家投资范畴且资金在投入及使用之后需要偿还本金的项目，其涉及到的减免增值税将无需缴纳企业所得税；
其次，对于其他类型的减免增值税，均应依法缴纳相应的企业所得税。此外，如果企业享受的减免增值税符合特定的专项用途财政性资金标准，依据相关规定，将享有免征企业所得税的待遇。

《中华人民共和国个人所得税法》第五条
有下列情形之一的，可以减征个人所得税，具体幅度和期限，由省、自治区、直辖市人民政府规定，并报同级人民代表大会常务委员会备案：
（一）残疾、孤老人员和烈属的所得；
（二）因自然灾害遭受重大损失的。国务院可以规定其他减税情形，报全国人民代表大会常务委员会备案。