个体户注销营业执照的程序如下：
1、先将公司银行账户中的钱全部转走，进行银行销户；
2、有未开具的空白发票的，先在开票系统中将未开具的空白发票进行作废；
3、带着发票领购簿和未开具的空白发票到税务局进行验票，没有问题后，税务局会收回发票领购簿并告知回去对金税盘进行修改时钟，并进行抄当月税；
4、金税盘修改好时钟，完成抄税后，携带金税盘，税务登记证正副本，公章，对金税盘和税务登记进行注销，税务局受理后3-5个工作日会出具税务事项通知书予以核准注销；
5、携带营业执照正副本、和税务局出具税务事项通知书原件及复印件、公章到工商局注销营业执照。

《个体工商户条例》第十二条
个体工商户不再从事经营活动的，应当到登记机关办理注销登记。