一般来说，在遇到交通事故时，鉴定费一开始是由申请鉴定的那一方先垫付的。
等整个诉讼流程结束后，最终的承担方是败诉的那一方。
要是交通事故的责任非常明确，就是一方全责的话，那在打官司的时候，这鉴定费通常就应该由全责的那一方来承担。
这可是有依据的，是根据《诉讼费用交纳办法》来规定的，因为鉴定费属于诉讼费用的一种。
在民事诉讼的过程中，一般遵循的原则是“谁主张，谁负担”，也就是说申请做鉴定的那一方要先把费用给垫付了，最后，就按照判决的结果，由败诉的那一方来承担这笔费用。
不过，如果双方对于责任的认定有争议，而且各自都申请了鉴定，那这个时候鉴定费可能就得按照责任的划分比例来进行承担。
总之，交通事故鉴定费到底由谁来承担，得根据具体的责任认定情况以及诉讼的最终结果来确定。
要是大家对这方面有疑问的话，还是可以进一步去咨询专业的律师，他们能给大家更准确的解答和建议。

案情回顾:

小朱与小李发生交通事故，小朱申请鉴定并垫付鉴定费。小朱起诉小李，双方对事故责任认定存在争议，小朱认为小李全责，小李则认为双方都有责任，且小李也申请了鉴定。最终法院判决小李承担主要责任。

案情分析:

1、根据《诉讼费用交纳办法》，鉴定费属于诉讼费用，一开始由申请鉴定方垫付，所以小朱和小李各自垫付了自己申请鉴定的费用。
2、因法院判决小李承担主要责任，即小李败诉，按照“谁败诉，谁承担”原则，小朱垫付的鉴定费应由小李承担，而小李垫付的鉴定费按责任划分比例由双方分担。