一般来讲，当发生交通事故使得出租车无法正常运营时，由此产生的合理停运损失，在保险的范畴内，保险公司是应该进行赔偿的。
依据相关的法律条文，交强险以及商业三者险在其规定的责任限额内，要承担赔偿的责任，这里面就包含了因事故而引发的直接财产损失，像出租车的停运损失这类情况。
不过要特别留意，保险公司进行赔偿通常是以保险合同的约定为基础的，如果合同中明确地把停运损失等间接损失的赔偿责任给排除掉了，那么保险公司就有可能不会给予赔偿。
与此同时，被保险人必须要提供足够充分的证据，来证明停运损失的合理性以及实际发生的金额，比如出租车的营运证，用于证明其具备合法的营运资格；还有租赁合同，能说明出租车的使用情况；以及停运期间的相关费用凭证等，这些都能有力地支持被保险人的索赔。
总之，到底保险公司是否会赔偿出租车的停运损失费，得依据具体的保险合同以及实际的情况来综合判定。

案情回顾:

小朱驾驶出租车与小李的车发生交通事故，小朱的出租车无法正常运营产生停运损失。小朱向保险公司索赔停运损失，保险公司以保险合同约定排除间接损失赔偿责任为由拒绝赔偿，双方产生争议。

案情分析:

1、交强险及商业三者险按规定应在责任限额内承担赔偿责任，包含直接财产损失，出租车停运损失理论上在赔偿范围内。
2、若保险合同明确排除停运损失等间接损失赔偿责任，保险公司可能据此不赔。
3、小朱需提供营运证、租赁合同、停运期间费用凭证等充分证据证明停运损失合理性及实际金额，否则索赔难获支持。