保险垫付的18000元在理赔时并非一定会被扣除。
通常来讲，倘若垫付是依据保险合同所约定的先行支付行为，并且与最终的理赔事宜存在关联，那么在进行理赔计算时就有被抵扣的可能。
比如，在遭遇交通事故时，保险公司先行垫付了18000元的医疗费用。
而最终的理赔金额是基于被保险人所遭受的实际损失，这里面涵盖了医疗费用、伤残赔偿等多个方面。
要是垫付的这18000元恰好包含在实际损失的范围之内，那么在进行理赔的时候，就很有可能会从总的理赔金额中把它扣除掉。
但要是垫付是出于人道主义等其他的缘由，和理赔事项之间并没有直接的关联性，那么一般情况下是不会在理赔的时候进行扣除的。
总之，到底是否会扣除保险垫付的18000元，这需要依据具体的保险合同以及理赔的实际情况来加以确定。
倘若大家对此存在疑问，那么可以及时咨询保险公司或者专业的律师，以便能够获得准确的解答和指导。

案情回顾:

小朱驾车发生交通事故，受伤入院。保险公司依据合同先行垫付了18000元医疗费用。后续理赔时，小朱认为垫付费用不应从理赔款中扣除，保险公司则认为应按规定扣除，双方产生争议。

案情分析:

1、若保险公司的垫付是依据保险合同约定的先行支付行为，且与最终理赔相关联，如垫付的18000元在被保险人实际损失范围内，那么从理赔金额中扣除是合理的。
2、若垫付是出于人道主义等与理赔事项无直接关联的缘由，那么一般不应在理赔时扣除，具体需结合保险合同及实际情况确定。