1.停运损失保险公司是否给予赔偿，关键要看具体的保险合同。
2.首先，如果保险合同中清晰地规定了包含因保险事故而引发的停运损失，并且该事故也在保险责任的范畴之内，那么此时保险公司就应当进行赔偿。
比如，某些专门针对营业性车辆的保险合同，就可能对因事故导致的停运损失作出赔付约定。
3.然而，一般情况下，交强险和商业三者险通常是不会赔偿停运损失的。
这是因为这两类险种的主要保障范围是在交通事故中对第三方造成的人身伤亡和财产损失进行赔偿，而非车辆自身的停运损失。
只有当车主投保了诸如营业性车辆损失险、道路客运承运人责任保险等特定的险种时，才有可能在发生符合条件的事故后，对停运损失进行赔偿。
4.具体到是否赔偿以及赔偿的范围等问题，必须依据保险合同条款以及相关的法律法规来确定。
如果在赔偿事宜上存在争议，车主可以通过诉讼等合法方式来解决，以维护自身的合法权益。
案情回顾:
小朱驾驶自己的营业性车辆与小李的车发生碰撞，事故导致小朱车辆受损停运。小朱向自己的保险公司索赔停运损失，保险公司以交强险和商业三者险不赔停运损失为由拒绝，小朱认为保险合同应赔，双方产生争议。
案情分析:
1、若小朱所投保险合同明确规定包含因保险事故引发的停运损失，且事故在保险责任范畴内，保险公司应赔偿，比如专门针对营业性车辆的相关合同有此约定时。
2、一般交强险和商业三者险主要保障第三方人身伤亡和财产损失，不赔车辆自身停运损失，只有投保特定险种才可能赔停运损失，具体需依合同和法规确定。