当摩托车遭遇被撞并被认定为全损时，通常可以按照以下步骤来处理。
首先，必须要积极与肇事方以及对方的保险公司进行协商，全力确定损失的具体金额以及赔偿的方式。
对方的保险公司会派遣专业人员对车辆进行详细的定损评估，通过对车辆购置价、使用的年限以及车辆的实际状况等诸多因素进行综合考量，从而核算出应当给予的赔偿金额。
在协商的这个过程当中，你有权利要求对方赔偿车辆的实际价值，这里的实际价值涵盖了购车款、购置税等一系列与之相关的费用。
倘若协商无法达成一致意见，那么就可以通过诉讼的途径来解决问题，向法院提起民事诉讼，明确要求肇事方以及保险公司承担相应的赔偿责任。
与此同时，一定要格外注意妥善保留好相关的证据，比如事故现场的照片，这些照片能够清晰地展现事故发生时的场景以及车辆的受损情况；
还有车辆的维修清单，它可以详细记录维修的项目和费用；
以及保险合同，保险合同中明确规定了双方的权利和义务，这些证据在索赔的过程中将会起到至关重要的作用，能够有力地帮助你维护自身的合法权益。