三期鉴定费通常一开始是由申请进行鉴定的那一方先把钱垫付起来。
在整个诉讼的过程当中，如果最后的鉴定结果是对自己这一方有利的，那么这笔费用就可以让对方来承担；要是鉴定结果对自己这一方不利，那费用就得由申请鉴定的那一方自己承担。
不过，具体到底该怎么承担这个费用，得依据双方在这个案件里面所承担的责任比例，还有相关的法律规定以及当初签订的合同约定来确定。
要是双方在合同里面已经很明确地约定好了鉴定费的承担方式，那就一定要按照合同的约定来执行；要是合同里没有约定，一般就按照前面所说的那些原则来处理。
总而言之，三期鉴定费到底由谁来承担可不是绝对的，得根据具体的实际情况去进行判断，然后双方还可以进行协商。

案情回顾:

小朱与小李因一民事纠纷涉诉，小朱申请三期鉴定并垫付了鉴定费。鉴定结果出来后，小朱认为鉴定结果对自己有利，要求小李承担鉴定费，小李则认为自己不应承担，因为双方在合同中未明确约定鉴定费承担方式，双方产生争议。

案情分析:

1、若合同有明确约定，应按约定执行，现合同未约定，需考虑其他因素。
2、按照一般原则，若鉴定结果对申请方有利，对方承担；不利则申请方承担，但也需依据双方责任比例等综合判断，双方可协商解决鉴定费承担问题。