工程违约金主张时效从违约的第一天开始计算，也就是超过合同约定日期的第一天。违约行为发生之日，违约金的诉讼时效亦开始起算。其后续时间对债权构成或数额变化不产生任何影响，无须时间补充即告成立和完成。
工程延期竣工如果要追究责任的话，要在诉讼时效区间内进行追诉，一旦超过追诉的有效区间，就失去了追索权。建筑工程延期的第一天即可以开始追究负责人的责任，要求主张违约金的赔偿，若果是在工程延期竣工后很长时间，比如三年后，追诉权已经失效了。

《民法典》第五百八十五条
当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法
约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。