医疗事故次要责任的赔偿主要涵盖以下这些方面：
首先是医疗费方面，这里所说的医疗费是指患者在治疗过程中实际产生的医疗费用，不过要把医保已经报销过的那部分扣除掉。
其次是误工费，它的确定要依据患者的误工时间以及收入状况。
误工时间得按照医疗机构出具的相关证明来确定，而收入状况则参照患者误工之前的平均收入来计算。
这样就能较为准确地算出患者因误工而减少的收入损失，从而在赔偿中给予相应的补偿。
再者是护理费，这需要根据护理人员的收入状况、护理人数以及护理期限来综合确定。
不同的护理人员收入不同，护理人数的多少也会影响赔偿金额，护理期限则根据患者的实际护理需求来定。
还有住院伙食补助费，通常可以参照当地国家机关一般工作人员的出差伙食补助标准来予以确定。
这样能保证患者在住院期间的伙食费用得到合理的赔偿。
营养费方面，要根据患者的伤情以及医疗机构的意见来确定。
伤情严重的可能需要较高的营养费来辅助恢复，医疗机构的意见则能为营养费的确定提供专业依据。
最后是残疾赔偿金，这是根据伤残等级来计算的。
按照受诉法院所在地上一年度城镇居民人均可支配收入或者农村居民人均纯收入标准，从定残之日起按二十年计算。
但如果患者年龄在六十周岁以上，每增加一岁就减少一年；七十五周岁以上的，则按五年计算。
在具体计算赔偿金额时，必须综合考虑以上各项因素，并且要严格依据相关法律规定和证据来进行确定，以确保赔偿的公平合理。

案情回顾:

小朱在医院治疗时，因医疗事故受到伤害。医院承担次要责任。在赔偿协商中，双方对医疗费扣除医保报销部分、误工费计算依据、护理费标准等赔偿项目的确定存在争议，小朱认为赔偿计算不合理，要求按自己理解足额赔偿，医院则坚持按规定计算。

案情分析:

1、医疗费应扣除医保报销部分，这符合实际损失赔偿原则，避免重复赔偿，小朱需理解并接受该计算方式。
2、误工费依据医疗机构证明和患者之前平均收入计算，是合理确定患者收入损失的方法，双方应据此协商。
3、护理费综合多因素确定，能反映实际护理成本，应按规定标准执行。
4、住院伙食补助费参照出差标准，营养费依伤情和医嘱，残疾赔偿金按伤残等级和年龄计算，均应严格依法确定。