医疗机构要是出具了虚假的证明，要是情节不算严重，卫生行政部门就会责令其改正，同时给予警告，并且还可以对其处以五千元以下的罚款。
要是造成了很严重的后果，像是误诊使得患者的病情被耽误了之类的情况，除了要责令改正、给予警告之外，还可以处以五千元以上一万元以下的罚款。
要是构成了犯罪，那就得依法去追究刑事责任了。
比如说，医疗机构明明是故意出具虚假的诊断证明，结果让患者错过了最佳的治疗时机，进而造成了严重的身体损害，甚至导致了患者死亡等这样的后果，那肯定是会依法以医疗事故罪等罪名来追究刑事责任的。
总之，医疗机构必须得严格地遵守相关的法律法规，一定要保证所出具证明的真实性和准确性，绝对不能为了任何私利而出具虚假证明，否则就要承担相应的法律责任。