对于快递公司的罚款制度是否具备合法性，需要我们进行更具针对性的具体深入分析。
在某些情况下，若罚款的出现源于已签订的明晰规范的合同条款中，并且该条款既体现出公平合理原则同时又严格遵守了相关的法律法规，那么可以认为此时的罚款行为是具有合法性的。
然而，若是罚款缺乏公正合理的理由，或者罚款数额过于庞大，对员工或合作伙伴的合法权益造成了极其严重的侵害，那么这种情况便有可能使罚款失去其合法性。
举例来说，假设某家快递公司以员工未实现超高难达的业务指标为由实施罚款，那么这样的做法往往无法得到法律的认可和支持。

《中华人民共和国民法典》第五百零九条
当事人应当按照约定全面履行自己的义务。
当事人应当遵循诚信原则，根据合同的性质、目的和交易习惯履行通知、协助、保密等义务。
当事人在履行合同过程中，应当避免浪费资源、污染环境和破坏生态。