关于侵权纠纷案件的适用诉讼时效制度，依据相关法律规定，侵权纠纷的诉讼时效期限为三年。
在法律另有特别规定的情形下，应遵循其具体规定执行。
值得注意的是，诉讼时效期间的开始时间是从权利人明确知晓或应当预见到自身权益受到了侵害，以及相应义务人确定之日起开始计算。
然而，如果权利人自权益受损之日起已经超过了二十年，那么人民法院将不再提供保护；
但若存在特殊情况，人民法院可根据权利人的申请，依法决定适当延长诉讼时效期间。

《民法典》第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。