如果已经签订了抚养权协议，通常会按照以下不同情况来进行处理：
一、协议有效且双方遵守
当抚养权协议是双方真实意愿的体现，且协议内容不违背法律法规的强制性规定，同时双方都愿意严格遵守该协议时，这份协议就对双方具备法律上的约束力。
在这种情况下，双方应当按照协议中所约定的各项条款，切实履行好各自在抚养孩子方面的相关义务。
例如，在探视时间、抚养费的支付方式和数额等方面，都要依照协议来执行，以保障孩子的健康成长和生活的稳定。
二、一方想变更协议
有时候，一方可能会因为某些特殊情况而想要变更抚养权协议。
比如，自身的经济状况出现了严重的恶化，无法再像之前一样为孩子提供良好的生活条件；或者孩子实际的生活环境发生了重大的不利变化，像居住环境变得恶劣等。
此时，这一方可以先尝试与对方进行协商。
如果双方能够协商一致，那么就可以签订一份新的协议；但要是协商无法达成一致意见，那么想要变更的一方就可以向法院提起诉讼。
法院会综合各种因素，尤其是从有利于孩子健康成长的角度出发，来判定是否变更抚养权。
三、协议存在违法违规情况
若协议内容中存在违反法律规定的条款，例如不合理地限制对方的探视权等，那么这些违法的部分是无效的。
此时，双方可以先通过友好协商的方式对协议进行修改，使其符合法律规定；如果协商不成，也可以通过法律途径来解决，以确保协议的合法性和有效性。

案情回顾:

小朱与小李签订了抚养权协议，后小李因经济恶化想变更协议，双方协商不成，小李诉至法院。且协议中存在不合理限制小朱探视权的条款，引发争议。

案情分析:

1、最初协议若为双方真实意愿体现，内容不违法违规，双方应按约履行探视、抚养费支付等义务。
2、小李因经济状况恶化想变更协议，协商不成起诉后，法院会综合考量，从利于孩子成长角度判定是否变更抚养权。
3、协议中限制探视权条款违法无效，双方应协商修改，协商不成可通过法律途径解决，确保协议合法有效。