协议离婚后，如果发现存在共同财产纠纷，具体有以下几种处理方法：
一、双方协议重新签订离婚协议或者签订补充协议去婚姻登记处备案。
二、协议不成，可以去法院起诉申请对未分割财产进行分配。
若因为一方故意隐瞒、转移、变卖夫妻共同财产导致漏分，对于故意隐瞒、转移、变卖一方应少分或不分财产。

《民法典》第1092条
夫妻一方隐藏、转移、变卖、毁损、挥霍夫妻共同财产或者伪造夫妻共同债务企图侵占另一方财产，在离婚分割夫妻共同财产时，对该方可以少分或者不分。离婚后，另一方发现有上述行为的，可以向人民法院提起诉讼请求再次分割夫妻共同财产。