1.首先，依据法律条款，离婚协议中关于房屋归属的那部分约定是具备法律效力的。
倘若男方拒绝配合办理房屋过户手续，那么女方就可以凭借离婚协议向法院提起诉讼。
这是因为离婚协议在法律上是具有约束性的文件，一旦签署就应该得到履行。
2.在诉讼的整个过程中，女方必须要准备好离婚协议以及其他与之相关的证据，这些证据的作用是为了有力地证明房屋是归女方所有的。
比如离婚协议中明确记载房屋归属的条款、购房合同、付款凭证等，这些都可以作为证明房屋归属的重要依据。
3.法院在受理案件后，会严格按照法律规定以及具体的案件情况来作出判决。
其目的就是要求男方必须配合女方办理房屋的过户手续，以确保女方的合法权益得到保障。
法院会综合考虑各种因素，如离婚协议的合法性、房屋的实际情况等，来做出公正的判决。
4.如果男方在判决后仍然拒绝配合，那么法院将会采取强制执行措施。
这其中就包括将房屋直接过户至女方名下等手段，以强制男方履行法院的判决。
这样可以确保女方能够顺利地获得房屋的产权，避免因为男方的不配合而导致的一系列问题。
5.在整个过程中，女方要妥善地保管好相关的证据，像离婚协议、房屋产权证明等。
这些证据就如同她维护自身权益的武器，在诉讼过程中起着至关重要的作用。
只有确保这些证据的完整性和安全性，才能在诉讼中更好地维护自己的权益。
6.同时，女方也可以尝试与男方进行友好的协商。
通过沟通和协商，寻求一个双方都能够接受的解决方案，这样可以避免因为诉讼而产生的不必要的成本和时间消耗。
协商的过程中，双方可以充分表达自己的意见和需求，寻求一个共赢的局面。

案情回顾:

小朱和小李离婚，离婚协议约定房屋归小朱所有，但小李拒绝配合办理过户手续。小朱准备相关证据起诉，法院受理后按规定判决小李配合过户，若小李仍不配合，法院将强制执行，同时小朱也尝试与小李协商解决。

案情分析:

1、离婚协议关于房屋归属约定有效，小李拒绝配合过户违反协议，小朱有权起诉，这是维护自身合法权益的正当途径。
2、小朱准备充分证据如离婚协议、购房合同等，能有力证明房屋归属，为胜诉提供支撑。
3、法院判决会综合考量，保障小朱权益，要求小李配合过户是公正合理的。
4、若小李不执行判决，法院强制执行确保小朱获产权，符合法律规定。
5、小朱保管好证据能更好维权，在诉讼中占据主动。
6、协商是解决纠纷的可选方式，若能达成共识可节省成本和时间。