关于婚前财产公证后婚后收益的分配问题，需要根据不同情况具体分析，以下为你详细阐述：
一、孳息和自然增值部分
一方婚前财产在婚后产生的孳息和自然增值部分，通常情况下仍归婚前财产一方所有。
这是基于相关法律规定作出的明确判定。
举例来说，假如一方在婚前购买了一套房产，经过一段时间后，在婚后该房产因市场行情等因素自然升值。
这部分升值的金额就属于自然增值部分，一般会认定为房产所有人的个人财产。
再比如，婚前个人存款在银行产生的利息，若只是单纯因存款本身而产生的法定孳息，也同样属于婚前财产一方。
二、投资经营收益部分
如果婚前财产在婚后经过积极的投资经营行为产生了收益，情况则有所不同。
例如，一方用婚前的存款在婚后进行股票投资，通过对股票市场的分析、研究，积极买卖股票从而获得了收益。
除夫妻双方另有约定外，这部分收益通常应认定为夫妻共同财产。
在离婚时，这部分共同财产会按照夫妻共同财产的分割原则进行分配。
一般是均等分割，但在实际操作中，会综合考虑多种因素，适当照顾子女、女方和无过错方的权益，以确保分配结果更加公平合理。

案情回顾:

小朱与小丽婚前，小朱对其个人房产进行了财产公证。婚后房产因市场行情自然升值，同时小朱用婚前存款进行股票投资获得收益。后二人感情破裂准备离婚，就房产增值部分和股票投资收益的分配产生争议。

案情分析:

1、对于房产自然升值部分，依据法律规定，这属于小朱婚前财产的自然增值，通常应归小朱个人所有。因为该增值并非夫妻双方共同努力的结果，而是市场因素导致的。
2、对于股票投资收益部分，小朱是通过积极的投资经营行为获得收益，除夫妻双方另有约定外，这部分收益应认定为夫妻共同财产。离婚时，一般会均等分割，同时综合考虑多种因素，适当照顾相关方权益。